Есть база, в которую данные добавляются php.
Есть сервер ноды, который через вебсокеты рассылает эти данные. Как ноде дать понять, что данные были изменены, каким нить коллбеком или событием?
Сделайте обработчик http или любого другого протокола в нод-сервере, на который будете из php отправлять данный о том что база обновилась.
Или самой нодой проверяйте не обновились ли данные в базе.